清洁效果方面
牙线：牙线很薄且柔韧性好，能够轻松深入到牙缝和牙龈沟等牙刷难以到达的部位，与牙齿表面紧密贴合，通过上下移动可以有效清除附着在牙齿邻面的牙菌斑、食物残渣等，能全方位清洁牙齿邻面，保持口腔清洁。
牙签：牙签的形状相对较粗，难以进入较窄的牙缝，只能清理出牙缝中一些较大的食物残渣，对于紧密附着在牙齿表面的牙菌斑往往无能为力，无法达到理想的清洁效果。
对口腔健康的影响方面
牙线：正常使用牙线时，只要动作轻柔、方法正确，一般不会对牙龈和牙齿造成伤害。长期使用牙线有助于预防龋齿、牙周炎等口腔疾病，对维持牙龈健康和牙齿稳固有积极作用。
牙签：由于牙签质地较硬，如果使用不当，比如用力过猛或角度不对，很容易刺伤牙龈，导致牙龈出血、疼痛，甚至引发牙龈炎症和感染。长期不正确地使用牙签还可能使牙缝逐渐变大，增加食物嵌塞的风险，进一步影响口腔健康。
使用体验和便捷性方面
牙线：牙线有多种形式，如普通牙线、带棒牙线等，携带方便，使用时可以根据需要截取合适的长度，操作相对简单。而且使用牙线后不会产生像牙签使用后可能出现的碎屑残留问题。
牙签：虽然牙签也便于携带，但使用时可能会有木刺或竹刺等碎屑残留，需要额外注意清理。并且，在一些公共场合使用牙签可能会被认为不太雅观。
卫生方面
牙线：牙线通常是一次性使用，用完即弃，避免了交叉感染的风险。同时，牙线的生产和包装过程都有严格的卫生标准，能保证使用时的清洁度。
牙签：部分牙签可能存在消毒不彻底的情况，尤其是一些非正规渠道购买的牙签。而且如果牙签使用后随意放置，再次使用时容易沾染细菌，增加口腔感染的几率。
