毛主席在《矛盾论》中写道：“事物发展的根本原因，不在事物的外部而是在事物的内部，在于事物内部的矛盾性。任何事物内部都有这种矛盾性，因此引起了事物的运动和发展。事物内部的矛盾性是事物发展的根本原因，一事物和他事物的互相联系和互相影响则是事物发展的第二位原因。”
任何事物的变化与发展都是由“内部原因”与“外部原因”共同作用产生的。外因是变化的条件，内因是变化的根源，外因通过内因而起作用。鸡蛋在合适的温度下可以孵化出小鸡，但同样的温度却不能让石头孵化出小鸡，因为石头与鸡蛋的内因不同。
问题的根本解藏在事物的内因中，我们分析处理事物时，若要在根本上解决问题，应着手于剖析事物的内在矛盾，分析事物内在的性质与规律，把握住事物内在的主要矛盾与主要矛盾的主要方面。
外因和内因从表面上看是同等重要的原因，毕竟鸡蛋若没有合适的温度无法孵出小鸡，所以这就导致不少人会习惯从外因寻找引发事物变化的根本原因。但实际上事物的根本原因不可能藏在外因中，因为事物本身的性质若没有发生改变，即使这一次改变外因解决了问题，但若下次又遇到同样的外因，问题还是会再次发生。
因为外因通常是更容易被看见，内因通常会藏得比较深，所以每当出现问题时，人们都习惯解决外因，若每次都是通过解决外因去解决问题，那么问题必将还会继续发生，长期以往将会疲于奔命。此外，不少外因是由客观环境所致，解决起来并非那么容易，有些甚至非人力所能及。所以处理问题时通过解决外因既不能从根本上解决问题，解决外因的难度也并不容易。
这就要求我们在解决问题时要着眼于内因，从内因中寻找根本原因，在根本原因中寻求根本解。因为从根本上解决了这一个问题，就能连根解决掉由此根源产生的成百上千个派生问题，此乃解决问题的上上策——从根本上解决问题。
复杂事物内部会有多对矛盾同时存在，其中必定有一对矛盾是起领导、决定作用的主要矛盾，其他矛盾则处于次要和服从地位。因为我们在解决问题时首要任务是抓住它的主要矛盾，根本原因就藏在主要矛盾中。
毛主席在《矛盾论》中写道：“事物的性质主要地是由取得支配地位的矛盾的主要方面所规定的。取得支配地位的矛盾的主要方面起了变化，事物的性质也就随着变化。”
当一事物发生问题时，说明该事物内部主要矛盾的主要方面发生了问题，根本原因就发生在主要矛盾的主要方面，解决了主要矛盾的主要方面就是解决了主要矛盾，就改变了事物的性质，就从根本上解决了问题。
当我们着手解决问题时，首先区分清晰内因和外因。因为根本原因藏于内因之中，所以我们要着重分析内因。通过分析内因分析事物的内在性质，分析事物的矛盾，在多对矛盾中揪出主要矛盾，问题的根源在于主要矛盾的主要方面上，解决主要矛盾的主要方面就能从根本上解决问题，当主要矛盾被解决后事物的性质将随之改变，问题也随之解决。
这就是从本根上解决问题的方法论。可因解决一个问题，从而解决成百上千个由该根源导致的问题。
