两者存在不少区别，下面介绍几点核心区别：
一、法律性质和设立依据不同
个人独资企业性质为“企业”，可以设立分支机构，主要法律依据是《个人独资企业法》，而个体工商户的性质仍为“自然人”，不能设分支机构，法律依据是《民法典》中“自然人”的第四节规定，以及《促进个体工商户发展条例》。
不过由于两者都是市场上的经营主体，都属于更广一级的“市场主体”，所以两者均可适用《中华人民共和国市场主体登记管理条例》的规定。
二、投资和经营者不同
个人独资企业的投资人只能是一个自然人，投资人即为企业拥有者，但由于企业管理可以施行投资与管理相分离的政策，经营人也可以是投资人对外聘请的经理人；而个体工商户原则上出资的人和经营者都是同一个自然人，不过法律允许家庭经营个体工商户，此时登记的经营者为主持经营的个人，组织形式上则记载为“家庭经营”（否则为“个人经营”），一起经营的家庭成员需要办理备案。
三、承担债务的能力和范围有不同
个人独资企业不具备法人资格，属于非法人组织，其投入企业的资产不足清偿债务时，应由投资的个人继续承担无限清偿责任；而个体工商户性质为个人，因此，也需要对个体户经营的债务承担无限清偿责任，而且会因经营者范围不同而不同，个人经营的以个人财产清偿，家庭经营的以家庭财产承担，如果个人经营还是家庭经营无法区分的，则以家庭财产承担。
四、建账和征税差异
个体户为自然人，所以经营所得应按个人所得税征收，根据《个体工商户建账管理暂行办法》的要求，分不同规模建账，然后对应采取查账征收、定额征收或两者相结合的方式征收；而个人独资企业属于企业，则必须建账，原则上应查账征收，不过征收上仍比照个体工商户征收个人所得税。
五、诉讼主体差异
个人独资企业为非法人组织，可以独立以自己的名义参加诉讼；而个体工商户为自然人，参加诉讼时应当将个体工商户登记的商号（如有）列为诉讼主体，同时注明经营者的身份信息，即列为同一个诉讼主体。
以上供参考，希望对大家有所帮助！
