1959年，在高等军事学院学习的吴瑞林接到通知，让他转入海军工作，先让他接替东海舰队司令，后改为南海舰队司令。可他对转入海军工作，一直不松口，各首长都找他谈话开导。
吴瑞林将军或许在解放战争之前，没有听过他打过什么仗，但抗美援朝时期可是一位铁骨铮铮的军长，全程参与抗美援朝作战，是志愿军最能打的军长之一。
1953年率部撤回国后，调任海南军区司令员，驻守祖国南大门，前两任司令分别是吴克华、梁兴初，都是善于打硬仗、恶仗的指挥员。
在海南军区工作几年后，调去高等军事学院脱产学习，按说应该在1960年7月毕业，可在1959年上级准备调他到东海舰队担任司令，因为东海舰队出了安全事故，调原司令陶勇任海军副司令。可陶勇工作上诚恳的态度，让海军党委决定暂时留下继续任职，让吴瑞林调去南海舰队担任司令。他去海军工作，是罗帅推荐的，或许是因为在军事上能力过硬。
海军属于大军区正职级别，下辖三个舰队北海舰队、南海舰队、东海舰队，都是正兵团级单位，由大军区与海军双重领导。也就是说，上级调他担任正兵团职司令，他却在犹豫，认为海军是技术军种，自己的学历不高，不能胜任。
为让他安心调任海军工作，总政副主任肖华找他交谈，让他不用担心边按边学，很多到海军工作的将领都一样，需要有一个由外到内的过程。他没有立即答应，海军司令萧劲光是他在东北作战时期的老首长，也即将是他海军的直属领导，他也找去谈话，谈起在解放战争时期，他的表现非常不错。言外之意，就是希望他到海军工作。
此后，政委苏振华也找他谈话，谈起在抗战时期，他们打仗的情况。虽然不在一个根据地，但相距不远，也是从思想上让他放轻松，不要有顾忌等。
为了让他尽快松口，萧劲光还委托高等军事学院副院长陈伯钧开导他，陈伯钧动之以情，晓之以理，从个人情况说了，也从部队建设情况说了，吴瑞林还是没有松口。
此后，苏振华、陈伯钧先后邀请他赴家宴，依然围绕工作调动的事情。还有40军军长邓岳邀请赴家宴，段苏权也请他吃饭，以及刘道生等。那几天，被人请吃饭就没有断过，大家或许都是来说服他到海军工作的。
或许经过思想斗争后，加上对南海舰队，以及上级的任命分析，最终答应上任。
