苏丹内战严重影响了两国协议的批准过程，也和俄罗斯两面下注有关系，尤其是俄罗斯最初通过瓦格纳支持 RSF 部队，后来转而支持苏丹政府。
俄罗斯自 2019 年以来一直在讨论在红海沿岸建造海军基地，但于 2024 年 2 月被推迟。然而，据两名苏丹情报官员和四名西方官员称，近几个月来，俄罗斯和伊朗一直在与苏丹政府谈判在事实上的首都苏丹港建立军事基地。这些谈判非常重要，因为在阿萨德政府垮台后，俄罗斯可能会失去在叙利亚的海军和空军基地。
据一名苏丹情报官员透露，为了就建设海军基地达成协议，俄罗斯甚至向当地政府提供了一套现代化的 S-400 防空导弹系统。显然，苏丹拒绝了这一提议，担心这会激起美国和其他西方国家的强烈反对。
尽管如此，对苏丹的燃料供应已经恢复，俄罗斯向苏丹出口了280万桶柴油和汽油，约占苏丹进口总量的47%。此外，11月底，据苏丹能源部称，能源部代表与俄罗斯天然气工业股份公司管理层举行了会谈，以恢复受损的石油基础设施，开发油田，并在苏丹港建造新的输油管道和炼油厂。
一名苏丹情报官员表示，俄罗斯也在向苏丹军队提供情报支持。这表明苏丹在东西方之间摇摆不定。他们接受俄罗斯的军事援助，但同时试图与西方保持相对良好的关系，西方曾多次呼吁苏丹停火。这也表明，在俄罗斯最初支持 RSF 之后，俄罗斯正试图修复与苏丹政府的关系。
通过在非洲部署苏联时代以来的第一个海军基地，俄罗斯可以控制苏伊士运河航线并确保在印度洋的永久存在，这是后苏联时代失去的。
